Анализ Кембриджского университета: геном коронавируса, полученный в Ухане, не дает информацию об исходном вирусе и источнике эпидемии
13.04.2020 00:00
8 апреля известное научное издание «Вестник Национальной академии наук США (PNAS: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)» опубликовал статью «Филогенетический анализ системы генома вируса SARS-CoV-2 (Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes)», соавторами которой являются исследовательские группы из Германии и Великобритании, как сообщает информационная служба мобильного приложения " Россия — Китай: главное".
Китайский телеканал CGTN представил видео-интервью с ведущим автором анализа, доктором наук из Кембриджского университета Питером Фостером (Peter Forster).
По словам Фостера, цель исследования заключалась в определении «типа первичного вируса».
В связи с быстрой мутацией традиционные методы бессильны в чётком понимании развития «цепочки мутаций» вируса COVID-19. В результате учёные применили метод «математического системного алгоритма», который используется, главным образом, для анализа ДНК при составлении карты миграции групп доисторических людей. Согласно итогам анализа 160 образцов нового коронавируса (SARS-Cov-2), собранных в разных уголках мира в период с 24 декабря 2019 года по 4 марта 2020 года, были обнаружены три главных его модификации, которые были условно названы типами A, B и C в соответствии с разницей в трансформации цепочки аминокислот РНК.
Итоги исследования показали большую разницу трёх типов вируса, географически расположенных в разных регионах мира. Типы A и C чаще всех встречаются В Европе и Америке, а тип B – распространен в странах Восточной Азии.
По сообщению Фостера, в пик распространения эпидемии в китайском Ухане был обнаружен коронавирус типа B, который ошибочно приняли за исходный вирус, хотя это не так, – в Ухане случаев инфекции исходного первоначального типа А было зафиксировано мало, там был зафиксирован тип В. Однако в дальнейшем тип В мутировал в тип С.
Результаты исследования показали, что около половины случаев инфекции вируса типа А находятся не в Восточной Азии, а в США и Австралии, между тем, две трети случаев в США относятся к типу А. Кроме того, несмотря на то, что вирус типа А ранее всего был обнаружен в Ухане, но там было очень мало случаев заражения этим типом вируса. Некоторые американцы, некогда проживавшие в Ухане, по итогам исследований, были носителями вируса типа А.
Коронавирус в Европе это вирус типа С, который также был обнаружен в США и Бразилии, но не был обнаружен в Китае. Однако этот тип был зафиксирован в Особом административном районе КНР Сянган, на Тайване Китая, а также в Сингапуре и Республике Корея.
Итоги исследования, по словам Фостера, показывают, что первый случай пневмонии вызванной коронавирусом нового типа, мог появиться из-за контактов с летучими мышами, это могло произойти в период с 13 сентября по 7 декабря 2019 года. Поэтому геном коронавируса, полученный в Ухане 24 декабря 2019 года, не даёт информацию об исходном вирусе и источнике эпидемии.